Персистирующая инфекция SARS-CoV-2, может вызвать геномные мутации

Исследование девяти пациентов с персистирующей инфекцией SARS-CoV-2 во время пандемии COVID-19 выявило появление нескольких мутаций, связанных с альфа- (линия B.1.1.7) и бета- (B.1.351) вариантами.

Персистенция инфекции SARS-CoV-2 у лиц с иммунодефицитом хорошо известна; однако последствия продолжающейся неразрешенной инфекции не полностью охарактеризованы. Люк Блэгдон Снелл (Королевский колледж Лондона, Лондон, Великобритания) и его коллеги выявили девять человек с ослабленным иммунитетом с персистирующей инфекцией SARS-CoV-2 в двух больницах Лондона (Великобритания) в период с марта 2020 года по декабрь 2021 года и изучили вирусную эволюцию у этих людей.

Иммунодефициты, связанные с персистирующей инфекцией у девяти человек, включали две трансплантации твердых органов, две ВИЧ-положительные инфекции и по одной терапии ритуксимабом, тимэктомию, гипогаммаглобулинемию, гематологические злокачественные новообразования и стероидное лечение. Средняя продолжительность между первым и последним положительным тестом на инфекцию SARS-CoV-2 составила 73 дня, хотя у двух из девяти пациентов была инфекция, которая сохранялась более 1 года, и один пациент был описан в сопроводительном пресс-релизе как имеющие положительный результат за 505 дней до их смерти — самая длинная известная инфекция COVID-19. Кроме того, Снелл и соавторы описали возникновение "скрытой" инфекции, при которой пациент дал положительный результат, впоследствии несколько раз дал отрицательный результат, а затем несколько месяцев спустя дал положительный результат на альфа-вариант. Однако к этому времени альфа-вариант был исключен из Великобритании, что говорит о том, что вирус присутствовал внутри человека все время.

Продольное секвенирование генома респираторных мазков и образцов сыворотки, взятых у всех девяти человек с персистирующей инфекцией, показало, что у пяти из девяти пациентов появились вирусные мутации, которые были связаны с вариантами беспокойства, включая два случая спайка E484K отмечен в бета-варианте и Q27 * отмечен в альфа-варианте.